Cậu bé nọ phát hiện ra một con robot bất tuân có khả năng biến đồ vật thành vũ khí mạnh mẽ. Để cứu thế giới khỏi một cyborg độc ác, cả hai phải hợp sức.
BoBoiBoy và những người bạn phải bảo vệ sức mạnh nguyên tố của cậu trước tên ác nhân cổ xưa đang tìm cách giành lại quyền kiểm soát sức mạnh đó cũng như tàn phá vũ trụ.